MBOAT7在肝癌组织中的表达及其生物信息学功能分析(1)
摘要:目的 利用数据挖掘分析 MBOAT7 在肝细胞癌中的表达情况,并进一步探讨 MBOAT7的生物学作用及功能。方法 利用 GEPIA数据库分析MBOAT7 基因在肝细胞癌中mRNA水平的变化,并对MBOAT7 基因的表达水平与肝细胞癌患者生存期进行分析。利用cBioPortal数据库和LinkedOmics数据库分析MBOAT7在肝细胞癌中共表达基因。利用Cytoscape3.7和STRING数据库对MBOAT7共表达基因进行生物信息分析。结果 与正常组织相比,肝细胞肿瘤组织中MBOAT7 基因在 mRNA 水平呈高表达(|Log2FC|Cutoff=0.5,P<0.01),MBOAT7 基因的高表达水平的肝细胞肿瘤患者的总体生存时间低于低表达的患者(HR=1.9,Log?rank P<0.01)。预测MBOAT7共表达基因共76个,共表达基因功能富集在amide transmembrane transporter activity、snRNP binding、hydro-lyase activity等生物学过程和功能(P<0 ......
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