《中华胰腺病杂志》:PCA-DM致病基因表达谱建立
中山大学孙逸仙医院胆胰外科在一项研究中建立了PCA-DM致病基因表达谱,发现了潜在的致病基因及具有潜在诊断价值的基因。该研究发表在2015年第5期的《中华胰腺病杂志》上。
该研究对前期获得的4例PCA-DM患者、4例无糖尿病胰腺癌(PC)患者和4例慢性胰腺炎(CP)患者胰腺组织基因芯片分析结果进一步进行盒图、火山图、热图分析;基因相互作用网络分析;染色体定位分析;Gene ontology(GO)分析,并采用实时PCR对差异表达基因进行验证。
结果表明,芯片检测质量可靠。PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因共2778个,其中表达倍数差异>10的有123个基因;无糖尿病PC与CP差异表达基因共7475个,其中表达倍数差异>10的有730个。PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因的数量及差异倍数明显少于无糖尿病PC与CP的差异表达基因。PCA-DM和无糖尿病PC的差异表达基因大多分布于PC与CP差异表达基因的染色体位点上。GO分析显示,与药物代谢、色素沉着、GTPase活性有关的条目上调,而与蛋白代谢、核酸代谢有关的条目下调.在PCA-DM相关基因网络中,HSPA1A、CSNK1A1、EIF4A2、MYCBP2、PRKRA、NGFR等40个基因参与PCA-DM发生。TFF1、MSMB、NOX1等13个基因对PCA-DM具有潜在诊断价值。
《医学科学报》 (第55期 第7版 国内期刊), 百拇医药
该研究对前期获得的4例PCA-DM患者、4例无糖尿病胰腺癌(PC)患者和4例慢性胰腺炎(CP)患者胰腺组织基因芯片分析结果进一步进行盒图、火山图、热图分析;基因相互作用网络分析;染色体定位分析;Gene ontology(GO)分析,并采用实时PCR对差异表达基因进行验证。
结果表明,芯片检测质量可靠。PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因共2778个,其中表达倍数差异>10的有123个基因;无糖尿病PC与CP差异表达基因共7475个,其中表达倍数差异>10的有730个。PCA-DM与无糖尿病PC差异表达基因的数量及差异倍数明显少于无糖尿病PC与CP的差异表达基因。PCA-DM和无糖尿病PC的差异表达基因大多分布于PC与CP差异表达基因的染色体位点上。GO分析显示,与药物代谢、色素沉着、GTPase活性有关的条目上调,而与蛋白代谢、核酸代谢有关的条目下调.在PCA-DM相关基因网络中,HSPA1A、CSNK1A1、EIF4A2、MYCBP2、PRKRA、NGFR等40个基因参与PCA-DM发生。TFF1、MSMB、NOX1等13个基因对PCA-DM具有潜在诊断价值。
《医学科学报》 (第55期 第7版 国内期刊), 百拇医药