“整合”一词蕴含着将人体和疾病的微观的、局部的知识整合到整体层面的过程，而整体方法则是直接把人体作为一个整体，从这个整体与环境的互动联系中去考察研究，通过拟合整体模型，借助模型揭示整体的内在规律。

    整体医学是基于复杂性科学的理念和方法，将中医药学的整体观念与现代科学的实证方法有机结合的全新的状态医学体系。

    整体医学的建立意味着，从还原分析走向整体综合的现代医学，与理论更加科学化、规范化的中医学，在未来发展的道路上将殊途同归。

    今天在医学界，整合的理念已经深入人心。与美国医学界20世纪80年代后期提出的“整合医学”不同，当今中国版的整合医学强调整体和局部的统一，注重从部分整合到整体的综合性与全面性。

    对此，中国工程院院士樊代明做出了诠释：整合医学就是将医学各领域最先进的知识理论和临床各专科最有效的实践经验分别加以整合，并根据社会、环境、心理的现实进行修整、调整，使之成为更加符合、更加适合人体健康和疾病治疗的新医学体系。

    要真正推进医学走向整合，需要构建整合的理论体系。而采用什么样的方法进行整合，整合医学如何构建它的理论体系？对此，医学界充满了期待。笔者认为，要真正弄清这个问题，需要拓宽观察的视角，以中医药理论为指导，把医学的整合放在生物学乃至整个自然科学的大环境中去考察。

    现代医学走向整合的两种路径

    系统生物学包含了生物体各个层面、各个部分的整合，最终要整合到整体层面，这是一种自下而上的整合。

    系统生物学最大的特点即整合。这里的整合主要包括三重含义。首先, 把系统内不同性质的构成要素(DNA、mRNA、蛋白质、生物小分子等)整合在一起进行研究；其次, 对于多细胞生物, 系统生物学要实现从基因到细胞、到器官、到组织甚至是个体的各个层次的整合。最后，研究思路和方法的整合。经典的分子生物学研究是一种垂直型的研究，即采用多种手段研究个别的基因和蛋白质。而基因组学、蛋白质组学和其他各种“组学”则是水平型研究, 即以单一的手段同时研究成千上万个基因或蛋白质。而系统生物学的特点, 则是要把水平型研究和垂直型研究整合起来, 成为一种“三维”的研究。

    在自然科学体系中，生物学一直是作为医学的基础 ......