生命科学名著Lewin基因X中文版.pdf
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2020年11月2日
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针对对分子生物学和分子遗传学进行了精彩的论述,Lewin 基因X(中文版)包含了基因的结构、序列、组织和表达,它是由21位科学家编写和修正了其各自领域的相关内容,非常全面的一个基因参考书,精品站提供了lewin基因x。

详细目录
前言
关于作者
第1部分基因和染色体1
第1章基因是DNA2
1.1引言3
1.2DNA是细菌的遗传物质4
1.3DNA是动物细胞的遗传物质6
1.4多核苷酸链含有连接含氮碱基的糖磷酸骨架7
1.5超螺旋影响DNA结构8
1.6DNA是双螺旋10
1.7DNA复制是半保留的12
1.8聚合酶在复制叉处作用于分开的
DNA链13
1.9遗传信息可由DNA或RNA提供14
1.10核酸通过碱基配对进行杂交16
1.11突变改变DNA序列18
1.12突变影响单个碱基对或更长序列19
1.13突变效应可逆转20
1.14突变集中在热点21
1.15一些热点来自修饰的碱基22
1.16一些遗传因子是非常小的23
1.17小结24
参考文献25
第2章基因编码蛋白质27
2.1引言28
2.2一个基因编码一条肽链29
2.3同一基因上的突变不能互补30
2.4突变可能引起功能的丧失或获得32
2.5一个基因座可有不同的突变等位基因32
2.6一个基因座可能会有不止一个野生型等位基因33
2.7DNA的互换产生重组34
2.8遗传密码是三联体36
2.9每一序列具有三种可能的阅读框38
2.10原核生物基因与其蛋白质呈共线性关系39
2.11表达一个基因的蛋白质产物需要几个过程40
2.12蛋白质呈反式作用而DNA上的位点呈顺式作用42
2.13小结43
参考文献43
第3章分子生物学与遗传工程中的方法学44
3.1引言45
3.2核酸酶46
3.3克隆48
3.4克隆载体可因不同目的而专一化51
3.5核酸检测54
3.6DNA分离技术57
3.7DNA测序60
3.8PCR和RTPCR62
3.9印迹方法67
3.10DNA微阵列70
3.11染色质免疫沉淀73
3.12基因敲除和转基因物种74
3.13小结80
第4章断裂基因82
4.1引言83
4.2断裂基因由外显子和内含子组成84
4.3外显子和内含子由不同的碱基组成85
4.4断裂基因的结构是保守的86
4.5在负选择时外显子序列保守而内含子序列变化多端88
4.6在正选择时外显子序列变化多端而内含子序列保守89
4.7基因大小的变化范围很广90
4.8某些DNA序列编码多种肽链92
4.9某些外显子与蛋白质功能域等同95
4.10基因家族成员具有共同的结构96
4.11遗传信息不完全包含在DNA之中99
4.12小结100
参考文献101
第5章基因组概述103
5.1引言104
5.2在不同的分辨率水平绘制基因组图105
5.3个体基因组呈现广范变化106
5.4利用RFLP和SNP绘制遗传图108
5.5真核生物基因组包含非重复DNA序列和重复DNA序列109
5.6外显子的保守性鉴定真核生物编码蛋白质的基因111
5.7基因组结构的保守性有助于鉴定基因114
5.8某些细胞器含有DNA116
5.9细胞器基因组是编码细胞器蛋白质的环状DNA分子118
5.10叶绿体基因组编码多种蛋白质和RNA120
5.11线粒体和叶绿体是通过内共生进化来的121
5.12小结122
参考文献122
第6章基因组序列和基因
数目125
6.1引言126
6.2细菌基因总数的差异可超过一个数量级127
6.3现已知多种真核生物的基因总数129
6.4基因有多少不同的类型131
6.5人类基因数目少于预期133
6.6在基因组中基因和其他序列的分布135
6.7Y染色体雄性特异基因136
6.8有多少基因是必需的138
6.9真核生物约10000个基因在不同层次广泛表达141
6.10可以整体测出表达基因的数目143
6.11小结144
参考文献145
第7章成簇与重复147
7.1引言148
7.2不等交换使基因簇发生重排150
7.3编码rRNA的基因形成包括恒定转录单位的串联重复153
7.4固定的交换使各个重复单元的序列保持完全相同156
7.5卫星DNA一般位于异染色质中158
7.6节肢动物卫星DNA具有很短的相同重复160
7.7哺乳动物卫星DNA由分级的重复序列所组成161
7.8小卫星序列可用于遗传作图165
7.9小结167
参考文献168
第8章基因组进化169
8.1引言170
8.2突变和分选机制使DNA序列进化171
8.3通过测量DNA序列变异可探查自然选择173
8.4DNA序列趋异的恒定速率就是分子钟177
8.5重复序列的趋异度可以度量中性替换率181
8.6断裂基因怎样进化182
8.7某些基因组为何如此之大185
8.8形态复杂性是通过增加新的基因功能进化而来的187
8.9基因重复在基因组进化中的作用189
8.10珠蛋白基因簇由重复和趋异形成190
8.12基因组多倍化(重复)在植物和脊椎动
物进化中的作用194
8.13转座因子在基因进化中的作用195
8.14在突变和基因转换以及密码子使用上的偏爱性196
8.15小结197
参考文献198
第9章染色体201
9.1引言202
9.2病毒基因组包装进它们的外壳里203
9.3细菌基因组是一个拟核结构206
9.4细菌基因组是超螺旋的208
9.5真核生物DNA具有附着于支架的环和结构域209
9.6特殊序列将DNA连接在间期基质上210
9.7染色质可以分为常染色质和异染色质211
9.8染色体带型213
9.9灯刷染色体侧环向外延伸214
9.10多线染色体形成横纹216
9.11多线染色体在基因表达位点出现染色体疏松217
9.12真核生物细胞染色体是一种分离装置218
9.13着丝粒局部含有组蛋白H3变异体和重复DNA序列219
9.14酿酒酵母中的点着丝粒具有必需的DNA短序列221
9.15酿酒酵母中的着丝粒与蛋白质复合体结合222
9.16端粒具有简单重复序列223
9.17端粒封闭染色体末端且在减数分裂的染色体配对中起作用224
9.18端粒由核糖核蛋白酶合成226
9.19端粒是生存必需的228
9.20小结229
参考文献230
第10章染色质233
10.1引言234
10.2DNA以核小体串珠方式组织235
10.3核小体是所有染色质的亚单元238
10.4核小体是共价修饰的243
10.5组蛋白变异体产生可变核小体247
10.6核小体表面的DNA结构变化249
10.7核小体在染色质纤丝中的途径252
10.8染色质复制需要核小体的装配254
10.9核小体是否位于特殊位点257
10.10在转录过程中核小体被置换和重新装配261
10.11DNA酶超敏性可检测染色质结构的改变265
10.12绝缘子是转录不相关的结构域267
10.13LCR可以调控一个结构域272
10.14小结274
参考文献276
第2部分DNA复制与重组279
第11章复制子280
11.1引言281
11.2复制子可以是线性的或环状的282
11.3复制起始点可用放射自显影和电泳技术显示284
11.4细菌基因组通常是单一环状复制子286
11.5细菌起始点的甲基化调控复制起始287
11.6复制后起始点可以被阻断288
11.7古细菌染色体可包含多个复制子290
11.8每条真核生物细胞染色体包含多个复制子290
11.9从酵母中分离复制起始点292
11.10许可因子控制了真核生物的再复制294
11.11许可因子由MCM蛋白组成295
11.12D环维持线粒体起始点297
11.13小结298
参考文献299
第12章染色体外复制子301
12.1引言302
12.2就复制而言线性DNA末端结构很重要303
12.3末端蛋白能够在病毒DNA的末端起始复制304
12.4滚环产生复制子的多联体305
12.5滚环被用来复制噬菌体基因组307
12.6通过细菌间的接合转移F因子308
12.7接合能转移单链DNA309
12.8植物中的细菌Ti质粒诱发冠瘿病311
12.9T-DNA携带感染所需的基因313
12.10T-DNA的转移类似于细菌接合316
12.11小结318
参考文献318
第13章细菌复制与细胞周期的关系320
13.1引言321
13.2复制与细胞周期的关系322
13.3隔膜将细菌分隔成各含一条染色体的子代323
13.4与分裂或分离有关的基因突变影响细胞形态324
13.5FtsZ蛋白是隔膜形成所必需的325
13.6min和noc/slm基因可调节隔膜定位327
13.7染色体分离可能需要位点专一性重组328
13.8分隔涉及染色体的分开330
13.9单拷贝质粒有一个分隔系统331
13.10质粒不相容性由复制子决定333
13.11ColE1相容性系统受控于RNA调节物334
13.12线粒体如何复制和分离337
13.13小结338
参考文献339
第14章DNA复制341
14.1引言342
14.2起始:在起始点oriC形成复制叉344
14.3DNA聚合酶是合成DNA的酶346
14.4DNA聚合酶有多种核酸酶活性347
14.5DNA聚合酶控制复制保真度348
14.6DNA聚合酶具有共同结构350
14.7两条DNA新链具有不同的合成模式351
14.8复制需要解旋酶和单链结合蛋白352
14.9启动DNA合成需要引发353
14.10前导链和后随链的协同合成355
14.11DNA聚合酶全酶由多个亚复合体组成356
14.12箍钳蛋白控制了核心聚合酶和DNA之间的结合357
14.13连接酶将冈崎片段连接在一起360
14.14真核生物中不同DNA聚合酶分别负责起始和延伸362
14.15T4噬菌体为自身提供复制装置365
14.16跨越损伤修复需要聚合酶置换366
14.17小结369
参考文献370
第15章同源重组与位点专一性重组373
15.1引言375
15.2同源重组发生在减数分裂中的联会染色体之间377
15.3双链断裂启动重组378
15.4基因转换导致等位基因之间的重组380
15.5依赖合成链的退火模型382
15.6非同源末端连接可修复双链断裂382
15.7单链退火机制在一些双链断裂处发挥作用384
15.8断裂诱导复制能修复双链断裂384
15.9减数分裂染色体由联会复合体连接386
15.10联会复合体在双链断裂后形成387
15.11配对与联会复合体的形成是两个独立过程390
15.12chi序列激活细菌RecBCD系统390
15.13链转移蛋白催化单链同化392
15.14Holliday连接体必须被解开395
15.15参与同源重组的真核生物基因397
15.16特化的重组涉及特异位点401
15.17位点专一性重组涉及断裂和重接402
15.18位点专一性重组类似于拓扑异构酶活性403
15.19λ噬菌体重组发生在整合体中405
15.20酵母通过开关沉默基因和活性基因座来转换交配型406
15.21受体MAT基因座启动单向基因转换408
15.22锥虫中的抗原变异运用同源重组410
15.23适合于实验系统的重组途径411
15.24小结414
参考文献415
第16章修复系统418
16.1引言419
16.2修复系统校正DNA损伤421
16.3大肠杆菌中的切除修复系统423
16.4真核生物核苷酸切除修复途径425
16.5碱基切除修复系统需要糖基化酶427
16.6易错修复430
16.7控制错配修复的方向431
16.8大肠杆菌中的重组修复系统434
16.9重组是修复复制差错的重要机制435
16.10真核生物中双链断裂的重组修复437
16.11非同源末端连接也可修复双链断裂438
16.12真核生物中的DNA修复与染色质背景有关440
16.13RecA蛋白引发SOS系统442
16.14小结445
参考文献445
第17章转座因子和反转录病毒449
17.1引言451
17.2插入序列是简单的转座因子452
17.3转座可通过复制和非复制机制产生454
17.4转座子引起DNA重排455
17.5复制型转座要经过一个共整合阶段457
17.6非复制型转座要经过链的断裂与重接458
17.7玉米转座子会引起断裂与重排460
17.8玉米中转座子形成几个家族462
17.9转座因子在杂种劣育中的作用465
17.10P因子在生殖细胞中被活化466
17.11反转录病毒生命周期包括类转座事件468
17.12反转录病毒基因编码多聚蛋白质469
17.13病毒DNA由反转录产生471
17.14病毒DNA整合到染色体中474
17.15反转录病毒能转导DNA序列475
17.16酵母Ty因子类似反转录病毒477
17.17黑腹果蝇中存在多种类型的转座因子479
17.18反转录因子分为三类480
17.19Alu家族具有许多广泛分布的散在重复序列成员482
17.20LINE利用内切核酸酶活性产生引发末端483
17.21小结485
参考文献487
第18章体细胞重组与免疫系统中的高变490
18.1免疫系统:先天免疫和获得性免疫492
18.2先天免疫应答利用保守的识别分子与信号通路493
18.3获得性免疫496
18.4克隆选择作用扩增出可应答给定抗原的淋巴细胞498
18.5Ig基因由淋巴细胞内多个分散的DNA片段装配而成500
18.6轻链基因由一次重组事件装配而成502
18.7重链基因由两次有序重组事件装配而成504
18.8重组产生广泛的多样性505
18.9免疫重组需要两类共有序列506
18.10缺失和倒位可产生V(D)JDNA
重组507
18.11有效重排引发等位基因排斥508
18.12RAG1/RAG2蛋白催化V(D)J基因区段的断开和重接510
18.13RNA加工可调节早期Ig重链的表达512
18.14由DNA重组来实施Ig的类型转换513
18.15CSR涉及NHEJ途径中的一些元件515
18.16小鼠和人类体细胞(SHM)产生了额外的多样性517
18.17SHM由AID蛋白?Ung蛋白?错配DNA修复(MMR)装置和损伤DNA合成(TLS)聚合酶导519
18.18假基因参与鸟类免疫球蛋白的装配520
18.19B淋巴细胞记忆可以引起快速强烈的次级免疫应答521
18.20BCR与TCR相关524
18.21TCR与MHC一起发挥作用525
18.22主要组织相容性基因座编码一群参与免疫识别的基因527
18.23小结530
参考文献532
第3部分转录与转录后机制539
第19章原核生物的转录540
19.1引言542
19.2转录发生在没有配对的DNA“泡”中并根据碱基互补配对原则进行543
19.3转录反应的三个阶段545
19.4细菌RNA聚合酶由多个亚基组成546
19.5RNA聚合酶全酶包括核心酶和σ因子548
19.6RNA聚合酶如何发现启动子序列549
19.7全酶在识别与逃逸启动子的过程中经历了转换反应550
19.8σ因子通过识别启动子中的特定序列来控制与DNA的结合552
19.9突变可增强或降低启动子效率554
19.10RNA聚合酶的多个区域可与启动子DNA直接接触555
19.11足迹法是一种可用于鉴定RNA聚合酶启动子和DNA蛋白质的相互作用的高分辨率方法558
19.12在启动子逃逸过程中σ因子与核心RNA聚合酶之间的相互作用发生改变560
19.13晶体结构提示酶的移动模型561
19.14停滞的RNA聚合酶可以再次启动563
19.15细菌RNA聚合酶的终止发生在离散的位点564
19.16ρ因子如何工作566
19.17超螺旋是转录的一个重要特征568
19.18T7噬菌体的RNA聚合酶是一个良好的模型系统569
19.19σ因子的竞争能调节转录起始570
19.20σ因子可以组织成几个级联反应572
19.21芽胞形成由σ因子控制573
19.22抗终止可以是一个调控事件576
19.23细菌mRNA的生命周期579
19.24小结581
参考文献582
第20章真核生物的转录587
20.1引言588
20.2真核生物的RNA聚合酶由多个亚基组成591
20.3RNA聚合酶Ⅰ有一个双向启动子592
20.4RNA聚合酶Ⅲ既使用下游启动子也使用上游启动子594
20.5RNA聚合酶Ⅱ的起点596
20.6TBP蛋白是一种通用因子597
20.7启动子上基础转录装置的装配600
20.8转录起始后紧随启动子清除和延伸603
20.9增强子含有能辅助起始的双向元件606
20.10增强子通过提高启动子附近激活因子的浓度而起作用607
20.11基因表达和去甲基化有关609
20.12CpG岛是调控靶标610
20.13小结612
参考文献613
第21章RNA的剪接和加工617
21.1引言619
21.2真核生物mRNA的5′端被加帽621
21.3细胞核内的RNA剪接连接点是各种短序列622
21.4剪接位点被成对解读624
21.5前mRNA剪接要经过一个套马索结构625
21.6snRNA是剪接所必需的626
21.7前mRNA的定型在剪接途径中的作用628
21.8剪接体组装途径631
21.9可变剪接体使用不同的snRNP加工次要类型的内含子634
21.10前mRNA剪接可能与Ⅱ类自我催化内含子共享剪接机制635
21.11暂时性和功能性的剪接与基因表达的多个步骤偶联637
21.12多细胞真核生物的可变剪接是普遍规律640
21.13剪接可被内含子和外显子的剪接增强子或沉默子所调节643
21.14反式剪接反应需要短序列RNA645
21.15经切割和多腺苷酸化产生mRNA的3′端648
21.16mRNA3′端的加工对于转录终止十分关键650
21.17组蛋白mRNA3′端的形成需要U7snRNA652
21.18tRNA剪接切割和重连是分开的两步反应653
21.19解折叠蛋白应答与tRNA剪接有关656
21.20rRNA的产生需要切割反应与短序列RNA的参与658
21.21小结661
参考文献662
第22章mRNA的稳定性与定位667
22.1引言668
22.2信使RNA是不稳定分子669
22.3真核生物mRNA始终以mRNP的形式存在671
22.4原核生物mRNA的降解与多种酶有关672
22.5大部分真核生物mRNA通过两条依赖于脱腺苷酸化的途径而降解674
22.6其他降解途径靶向特殊mRNA677
22.7专一性mRNA的半衰期由mRNA内的序列或结构所控制679
22.8细胞核监管系统对新合成mRNA进行缺陷检测681
22.9细胞质监管系统执行mRNA翻译的质量控制683
22.10某些mRNA能够被特异性地定位于某些细胞区域686
22.11小结689
参考文献690
第23章催化RNA693
23.1引言694
23.2Ⅰ类内含子通过转酯反应实现自我剪接695
23.3Ⅰ类内含子形成特征性二级结构698
23.4核酶具有各种催化活性700
23.5有些Ⅰ类内含子编码发起移动的内切核酸酶703
23.6Ⅱ类内含子可编码多功能蛋白质705
23.7某些自我剪接内含子需要成熟酶706
23.8RNA酶P的催化活性来自RNA707
23.9类病毒具有催化活性707
23.10RNA编辑发生在个别碱基709
23.11RNA编辑可由引导RNA指导711
23.12蛋白质剪接是自我催化的713
23.13小结715
参考文献716
第24章翻译719
24.1引言720
24.2翻译过程包括起始?延伸和终止722
24.3特殊机制控制翻译的精确性724
24.4细菌中的起始反应需要30S亚基和辅助因子725
24.5起始反应涉及mRNA和rRNA之间的碱基配对727
24.6一种特殊的tRNA起始子开始了肽链的合成728
24.7fMet-tRNAf的使用受IF-2因子和核糖体的调节730
24.8小亚基扫描查找真核生物mRNA的起始位点731
24.9真核生物使用由许多起始因子组成的一个复合体733
24.10延伸因子Tu将氨酰tRNA装入A位736
24.11肽链转移到氨酰tRNA上738
24.12易位使核糖体移动739
24.13延伸因子选择性地结合在核糖体上740
24.14三种密码子终止蛋白质合成742
24.15终止密码子由蛋白质因子所识别743
24.16核糖体RNA广泛存在于两个核糖体亚基上746
24.17核糖体拥有一些活性中心749
24.1816SrRNA在翻译中起着重要作用751
24.1923SrRNA具有肽基转移酶活性754
24.20当亚基聚集在一起时核糖体结构发生改变755
24.21小结756
参考文献758
第25章遗传密码的使用762
25.1引言763
25.2相关密码子代表了化学性质相似的氨基酸764
25.3密码子、反密码子识别涉及”摆动”766
25.4tRNA由较长的前体加工而来767
25.5tRNA含有修饰碱基768
25.6修饰碱基影响反密码子密码子配对770
25.7通用密码存在个别改变772
25.8新的氨基酸可以被插入到特定的终止密码子上774
25.9氨酰tRNA合成酶选择性地将氨基酸与tRNA配对775
25.10氨酰tRNA合成酶分为两个家族777
25.11合成酶利用校对功能来提高精确性779
25.12抑制因子tRNA使用突变的反密码子解读新密码子782
25.13每个终止密码子都有相应的无义抑制因子783
25.14抑制型可能与野生型竞争解读密码子784
25.15核糖体影响翻译的精确性786
25.16移码发生在不稳定序列上788
25.17其他再编码事件:翻译旁路途径和tmRNA机制可释放停滞的核糖体790
25.18小结791
参考文献792
第4部分基因表达794
第26章操纵子795
26.1引言797
26.2结构基因簇是被协同调控的800
26.3lac操纵子是负可诱导的801
26.4lac阻遏物由小分子诱导物所控制803
26.5用顺式作用的组成性突变来鉴定操纵基因805
26.6用反式作用的突变来鉴定调节基因806
26.7lac阻遏物是一个由两个二聚体组成的四聚体807
26.8构象的变构作用可调节lac阻遏物与操纵基因的结合809
26.9lac阻遏物与三个操纵基因结合并与RNA聚合酶相互作用812
26.10操纵基因与低亲和力位点竞争性地结合阻遏物813
26.11lac操纵子拥有第二层控制系统:代谢物阻遏815
26.12trp操纵子是一个由三个转录单位组成的可阻遏操纵子818
26.13trp操纵子也由弱化作用控制819
26.14弱化作用可被翻译控制821
26.15翻译是可调控的824
26.16r-蛋白合成的自体控制826
26.17小结827
参考文献828
第27章噬菌体策略831
27.1引言832
27.2细胞裂解进程分为两个时期834
27.3细胞裂解过程受一种级联反应控制835
27.4两种调节事件控制细胞裂解的级联反应836
27.5T7噬菌体和T4噬菌体基因组显示了功能性的成簇现象837
27.6细胞裂解周期和溶源化都需要λ噬菌体即早期和迟早期基因839
27.7裂解周期依赖于pN的抗终止作用840
27.8λ噬菌体阻遏蛋白维持溶源性841
27.9λ噬菌体阻遏物和它的操纵基因决定了免疫区843
27.10λ噬菌体阻遏物的DNA结合形式是二聚体843
27.11λ噬菌体阻遏物使用螺旋转角螺旋基序结合DNA845
27.12λ噬菌体阻遏物的二聚体协同结合操纵基因846
27.13λ噬菌体阻遏物维持自体调节回路848
27.14协同相互作用提高了调控的敏感性849
27.15cⅡ和cⅢ基因是建立溶源性所需的850
27.16弱启动子需要cⅡ蛋白的协助851
27.17溶源性需要一系列过程852
27.18裂解感染需要Cro阻遏物854
27.19是什么决定溶源和裂解周期之间的平衡856
27.20小结857
参考文献858
第28章真核生物的转录调控860
28.1引言861
28.2激活因子和阻遏物的作用机制863
28.3DNA结合域和转录激活域是相互独立的866
28.4双杂交实验检测蛋白质蛋白质的相互作用867
28.5激活因子和基础转录装置相互作用868
28.6多种类型的DNA结合域870
28.7染色质重塑是一个主动过程872
28.8核小体的结构或成分可在启动子处被改变875
28.9组蛋白乙酰化与转录激活相关877
28.10组蛋白甲基化和DNA存在联系880
28.11启动子激活涉及染色质的多种改变882
28.12组蛋白磷酸化影响染色质结构883
28.13基因如何开启885
28.14酵母GAL基因:一个用于激活和阻遏的模型886
28.15小结888
参考文献890
第29章表观遗传效应是可
遗传的895
29.1引言896
29.2异染色质从成核事件后开始传播898
29.3异染色质依赖于与组蛋白的相互作用900
29.4多梳蛋白和三胸蛋白为互相拮抗的阻遏物和激活因子903
29.5X染色体经受整体性变化905
29.6染色体凝聚由凝聚蛋白引起909
29.7CpG岛易于甲基化912
29.8DNA甲基化导致印记915
29.9单一中心控制着对立的印记基因917
29.10表观遗传效应可以遗传918
29.11酵母普里昂表现出不同寻常的遗传920
29.12在哺乳动物中普里昂可引起疾病923
29.13小结924
参考文献925
第30章调节RNA931
30.1引言932
30.2核酸开关可根据其所处的环境而改变其结构933
30.3非编码RNA可被用于调节基因表达935
30.4细菌含有调节RNA937
30.5微RNA在真核细胞中是广谱的调节物940
30.6RNA干扰如何工作943
30.7异染色质形成需要微RNA947
30.8小结949
参考文献949
词汇952
作者介绍
J.E.克雷布斯 从Bard学院(位于纽约州的Annandale-on-Hudson)获得了生物学的学士学位,从加利福尼亚大学伯克利分校获得分子与细胞生物学的博士学位。在她的博士论文中,研究了DNA拓扑结构的功能与转录调控中的绝缘子元件。
她以美国癌症学会的青年奖学金获得者身份,在马萨诸塞大学医学院的Craig Peterson博士实验室进行其博士后训练,此时她专注于组蛋白乙酰化的作用与转录中的染色质重塑。在2000年, Krebs博士到阿拉斯加大学(位于Anchorage)的生物科学系工
江松敏,博士,副教授。
1992年获复旦大学上海医学院(原上海医科大学)医学学士学位,1997年获复旦大学上海医学院(原上海医科大学)医学生物化学博士学位。1997.10-2002.6年在美国University of Kentucky Medical center,先后作为博士后和Research associate从事膜蛋白和酶的分离,纯化及其分子生物学和脂类代谢酶等的研究。从2002年9月至今任复旦大学生命科学学院副教授。
主要研究方向 :用分子遗传学、生物化学和分子生物学、酶学和糖生物学等手段, 研究肝癌发生发展的分子机理及治疗,诊断等方向。
内容简介
《Lewin 基因X(中文版)》对分子生物学和分子遗传学进行了精彩的论述,内容涵盖了基因的结构、序列、组织和表达。21位科学家编写和修正了其各自领域的相关内容,使得《Lewin 基因X(中文版)》成为相关领域当今颖、全面的参考书。其中大部分修订和重新编排是基于Lewin的《基因精要》第二版,并在内容上额外增加了一些新的章节,结构也进行了一些调整,使得全书各个主题在排列上更加富有逻辑性。许多章节也重新命名,以便更好地体现它们包含的内容。
《Lewin 基因X(中文版)》是分子生物学和分子遗传学最经典的名著之一,是生命科学各个分支学科的师生和研究人员必备的教科书和参考读物。
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内容摘要
这种方法的潜在问题是报道基因染料是非序列特异的,所以反应形成的任何假的产物将导致假阳性信号。在常规热循环末端,通常用熔点(melt point)分析来解决这个问题。将反应冷却到退火温度,再缓慢地提高温度,同时连续不断地检测荧光。那么,特定的扩增子会有特征性的熔点,此时荧光会消失,而非特异性扩增子会显示出幅度大的熔点,从而使样品荧光逐渐消失。
很多其他方法使用基于探针的荧光报道基因,这就避免了潜在的非特异信号。全程应用基于探针的方法称为荧光共振能量转移(fluorescence resonant energy transfer,FRET)法。用一个简单的术语,就是当两个荧光团靠得很近,其中一个(报道基因)的发射波长与另一个[猝灭剂(quencher)]的激发波长相匹配,那么就会发生FRET。报道基因染料发射波长发出的光子被邻近的猝灭剂染料有效俘获,而后在猝灭剂发射波长处重新发射。在这种方法的最简单形式中,在预定的扩增子内,与毗邻序列同源的两个短的寡核苷酸探针被用于实验反应,其中一个探针携带报道基因染料,另一个探针携带猝灭剂染料。如果反应中形成特异的PCR产物,那么在退火步骤中,两个探针能退火到单链产物上,使报道基因和猝灭剂分子紧密靠近。与报道基因染料的激发波长反应所发出的光将引起FRET,并在猝灭剂染料的特征性发射频率处发出荧光。相反地,如果这种探针分子的同源模板(预料的PCR产物)不存在,’那么两种染料就不会共定位,而报道基因染料的激发将引起在报道基因染料的发射频率处发出荧光,如图3.20所示。与结合DNA的染料方法一样,实时PCR仪器能监测每一循环的猝灭剂发射波长,产生相似的“s”形扩增曲线。目前已经存在多种能利用这个过程探查FRET的方法,包括5′荧光核酸酶(5′fluorogenic nuclease assay)测定、分子异标(molecular beacon)法和分子蝎(molecularscorpion)法。尽管这些方法的细节不同,但是基本原理是相似的,并以相似的方式产生数据。
PCR技术的应用非常广泛多样。在适当受控的反应中,扩增子的出现与否就能作为待检靶标模板分别存在与否的证据。这样它就可应用到医学中,如感染性疾病的探查,且在灵敏度、特异性与速率方面远远高于其他方法。因为两个引物位点是已知序列,其内部区域可以是普通长度的任何序列,这个事实使之直接应用于以下方面:在物种之间(或甚至个体之间)差异很大的区域的PCR产物可以被扩增出来进行序列分析,用于鉴定出样品模板的物种来源(或在后面例子中的个体身份)。
生命科学名著Lewin基因X中文版截图




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